Nachdem das Pentagon die IMF aufgelöst hat, muss Ethan Hunt es ohne Unterstützung der Regierung mit einem gefährlichen Feind aufnehmen. Das geheimnisvolle "Syndikat", eine internationale Untergrundorganisation aus hoch qualifizierten Spezialagenten, will alle ehemaligen Mitglieder der IMF beseitigen und durch Anschläge eine neue Weltordnung erzwingen. Ethan Hunt versammelt sein Team, um die Terrororganisation aufzuhalten. Hilfe erhält er dabei von der undurchsichtigen Agentin Ilsa Faust.